"A partir de demain jeudi 26 mars à 00:00 (04:00 GMT) entre en vigueur l'état d'urgence sanitaire (...) qui ira jusqu'au 15 avril", a annoncé la présidente par intérim, Janine Añez.
Cela implique une plus grande participation de l'armée et de la police dans le contrôle, ainsi que la fermeture des frontières, a précisé la dirigeante.
Seule une personne par famille a le droit de sortir du domicile pour aller faire des courses en semaine, et le confinement est absolu le week-end.
La Bolivie était entrée en quarantaine dimanche, mais une grande partie de la population a désobéi au confinement.
Les élections du 3 mai, qui devaient permettre aux Boliviens de désigner un successeur au président démissionnaire Evo Morales, ont par ailleurs été reportées sine die.
La Bolivie, qui compte 11 millions d'habitants, a répertorié 38 cas officiels de Covid-19.