Ribéry, 36 ans, a décidé au dernier moment de ne pas se rendre à Brême après s'être plaint de "problèmes neuromusculaires", a précisé le club sur son site.
L'ancien international français devrait mettre un terme à 12 ans de carrière au Bayern à la fin de la saison, formation avec laquelle il a remporté huit titres de champion et cinq coupes d'Allemagne.
Le Bayern affronte Brême pour la seconde fois en quelques jours, après s'être imposé samedi à Munich en championnat (1-0) contre le club nordiste.
Mercredi, les coéquipiers de Ribéry se rendent au Weserstadion (18H45 GMT) pour une place en finale de coupe d'Allemagne le 25 mai contre le RB Leipzig.
Outre Ribéry, les Bavarois seront aussi privés de l'attaquant néerlandais Arjen Robben et du gardien allemand Manuel Neuer, tandis que le défenseur central Niklas Suele est suspendu pour un match de coupe.