Le petit royaume africain est agité par une grave crise politique depuis que M. Thabane, 80 ans, a été mis en cause au début de l'année dans l'assassinat de son ex-épouse en 2017.
Pressé de quitter ses fonctions depuis des mois par son parti, la Convention de tous les Basoto (ABC), et la coalition qui soutient son gouvernement, le Premier ministre avait annoncé à l'AFP qu'il remettrait sa démission mercredi au roi Letsie III.
Le porte-parole de M. Thabane, Relebohile Moyeye, a toutefois fait savoir jeudi qu'il n'avait "reçu aucune information indiquant le Premier ministre avait démissionné".
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"Comme il (Thomas Thabane) n'a pas formellement présenté sa démission au roi, le roi a le pouvoir de le démettre de ses fonctions car le président du Parlement l'a officiellement informé que M. Thabane n'avait plus le soutien de sa majorité", a expliqué à l'AFP le président de la ABC, Samuel Rapapa.
"Nous attendons désormais du roi qu'il le démette de ses fonctions", a poursuivi M. Rapapa.
Au pouvoir depuis 2017, M. Thabane reste sous la menace de poursuites pour le meurtre de son ex-épouse. Sa deuxième épouse a déjà été inculpée dans ce dossier.
Le chef du gouvernement a toujours nié toute implication dans le meurtre de son ex-femme.