Le jugement, qui est final et ne souffrira pas d'appel, ordonne au ministre de la Jeunesse et des Sports de dissoudre le comité.
Deux candidats qui avaient participé à l'élection du 11 octobre 2012, avaient déposé plainte, déclarant les résultats truqués.
La prochaine élection doit avoir lieu en septembre 2016.
La Cour a également ordonné pour les mêmes raisons, la dissolution du comité directeur du club de Al-Ahly, en tête du championnat égyptien.
En novembre, une première décision avait ordonné la dissolution du comité directeur du club cairote, mais un appel avait été déposé.
Dimanche la cour a confirmé ce premier verdict.
Avec AFP