Cette affaire avait conduit à la suspension de la SLFA par la Fifa en octobre, l'instance mondiale du foot dénonçant le limogeage en septembre d'Isha Johansen et Chris Kamara comme une "ingérence" des autorités politiques dans le fonctionnement de la Fédération.
Les matches éliminatoires de la Sierra Leone pour la Coupe d'Afrique des Nations (CAN) 2019 avaient été annulés, avant que la Confédération africaine de football (CAF) ne disqualifie le pays en décembre.
Isha Johansen et Chris Kamara avaient été arrêtés en septembre 2016 et libérés sous caution à la suite d'une enquête de la Commission anti-corruption (ACC) avant d'être mis en examen en septembre 2017.
"Isha Johansen et Chris Kamara sont acquittés de tous les chefs d'accusation", a déclaré le juge Reginald Fynn devant une salle d'audience comble.
Ils devaient répondre de onze chefs d'accusation, dont ceux de détournement de donations et de fonds publics, complot pour commettre un acte de corruption et abus de pouvoir.
L'ACC les accusait notamment d'avoir détourné un don de 50.000 dollars de la CAF destiné à l'achat de matériel IRM.
"Nous avons perdu, à présent il faut faire une pause pour étudier le jugement avant de prochaines étapes", a réagi le président de l'ACC Francis Ben Kaifala sur twitter, sans préciser si la Commission comptait faire appel.
A l'énoncé du verdict, Mme Johansen et M. Kamara, tous deux vêtus de noir, ont versé des larmes de joie et étreint leurs avocats, sous les applaudissements. "Dieu merci, nous sommes enfin libres", s'est exclamé M. Kamara, faisant le "V" de la victoire.
Le gouvernement avait organisé en octobre une réunion de médiation au sein de la fédération, en présence des deux responsables limogés.
Un fan de football à Freetown, Mohamed Bangura, s'est dit "content que l'affaire de corruption dans le football soit terminée". "Maintenant la Fifa peut lever notre suspension", a-t-il déclaré à l'AFP.
En juillet 2014, une quinzaine de responsables et de joueurs sierra-léonais ont été suspendus après une série de matches suspects, dont une rencontre éliminatoire pour la Coupe du monde 2010 face à l'Afrique du Sud.
Mme Johansen, 54 ans, première femme à diriger la SLFA, possède son propre club de football, le FC Johansen.
